Naturaleza y característica de las comunidades, y los procesos que determinan su organización y los cambios en el espacio y en el tiempo. Diseño de estudios y aproximaciones metodológicas a campo, laboratorio y con computadoras para el estudio de comunidades biológicas. Enfoques ontológicos (holístico, individualista, otros) y las herramientas metodológicas derivadas (clasificación, ordenamiento). Estructura de las comunidades y su relación con el medio físico. Riqueza especifica, abundancia relativa, y composición. Diversidades alfa, beta, gama, taxonómica, funcional, filogenética. Patrones espaciales de diversidad. Efectos de la biodiversidad sobre procesos del ecosistema. Efectos de la competencia, predación, herborizaría, mutualismos (polinización, dispersión de semillas, protección, nutrición, otros), parasitismo, disponibilidad de recursos y disturbios en la estructura de comunidades. Teoría de nicho. Competencia en plantas y animales. Gremios. Tramas tróficas: enfoques descriptivo y funcional, redes clásica y microbiana, regulación desde arriba y desde abajo. Efectos indirectos. Estabilidad demográfica y no demográfica. Teoría de disturbio. Dispersión de semillas. Banco de semillas. Sucesión ecológica: mecanismos y características de especies tempranas y tardías. Invasiones biológicas: historia, característica de especies invasoras, resistencia de las comunidades, efecto en las comunidades, fase de las invasiones. Teorías de biogeografía de islas. Metacomunidades: concepto y estructura; modelos de formación de ensambles. Macroecología. Conservación de comunidades.